Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UtrnE9Q6R7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UtrnE9Q6R7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms