Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm20518E9Q548 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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