Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
ApobE9Q414 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC8.78□□□□□ -1
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ApobE9Q414 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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ApobE9Q414 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
ApobE9Q414 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
ApobE9Q414 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC8.77□□□□□ -1
ApobE9Q414 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC8.77□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC8.77□□□□□ -1
ApobE9Q414 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC8.77□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
ApobE9Q414 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
ApobE9Q414 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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