Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Susd1E9Q3H4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms