Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tarbp1E9Q368 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tarbp1E9Q368 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tarbp1E9Q368 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tarbp1E9Q368 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tarbp1E9Q368 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tarbp1E9Q368 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tarbp1E9Q368 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Tarbp1E9Q368 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tarbp1E9Q368 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tarbp1E9Q368 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tarbp1E9Q368 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tarbp1E9Q368 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tarbp1E9Q368 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tarbp1E9Q368 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tarbp1E9Q368 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tarbp1E9Q368 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tarbp1E9Q368 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tarbp1E9Q368 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tarbp1E9Q368 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms