Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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