Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms