Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms