Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms