Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms