Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms