Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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