Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms