Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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