Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71aB7XG49 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71aB7XG49 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71aB7XG49 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71aB7XG49 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71aB7XG49 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71aB7XG49 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71aB7XG49 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71aB7XG49 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71aB7XG49 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71aB7XG49 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71aB7XG49 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71aB7XG49 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71aB7XG49 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71aB7XG49 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71aB7XG49 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71aB7XG49 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam71aB7XG49 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms