Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Usf3B2RUQ2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Usf3B2RUQ2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Usf3B2RUQ2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Usf3B2RUQ2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Usf3B2RUQ2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usf3B2RUQ2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usf3B2RUQ2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usf3B2RUQ2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms