Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms