Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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PtprbB2RU80 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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PtprbB2RU80 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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PtprbB2RU80 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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PtprbB2RU80 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PtprbB2RU80 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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