Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930402K13RikB1AW18 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms