Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms