Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms