Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms