Protein–RNA interactions for Protein: A7XUZ6

Skint6, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint6A7XUZ6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms