Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttll9A2APC3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms