Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT1

Bfsp1, Filensin, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp1A2AMT1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bfsp1A2AMT1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms