Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms