Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms