Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms