Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 462.9 ms