Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms