Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nlrp1bA1Z198 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nlrp1bA1Z198 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nlrp1bA1Z198 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nlrp1bA1Z198 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nlrp1bA1Z198 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nlrp1bA1Z198 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nlrp1bA1Z198 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nlrp1bA1Z198 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nlrp1bA1Z198 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nlrp1bA1Z198 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nlrp1bA1Z198 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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