Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Top3bQ9Z321 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Top3bQ9Z321 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Top3bQ9Z321 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms