Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms