Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcniQ9Z2V9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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