Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Mrpl40Q9Z2Q5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Mrpl40Q9Z2Q5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Mrpl40Q9Z2Q5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Mrpl40Q9Z2Q5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Mrpl40Q9Z2Q5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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