Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms