Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Cldn8Q9Z260 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Cldn8Q9Z260 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Cldn8Q9Z260 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn8Q9Z260 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn8Q9Z260 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn8Q9Z260 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn8Q9Z260 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn8Q9Z260 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn8Q9Z260 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms