Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Sumo3Q9Z172 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Sumo3Q9Z172 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Sumo3Q9Z172 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms