Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cog1Q9Z160 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cog1Q9Z160 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms