Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms