Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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