Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms