Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn4Q9WU22 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn4Q9WU22 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms