Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms