Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms