Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms