Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Nek3Q9R0A5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Nek3Q9R0A5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Nek3Q9R0A5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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