Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms