Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms