Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 925 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Npas3Q9QZQ0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Npas3Q9QZQ0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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